Pytania i odpowiedzi
Dowiedz się więcej o naszej technologii.
Czy wynik pozytywny, uzyskany przy użyciu testu Genomtec® SARS-CoV-2 EvaGreen® RT-LAMP CE-IVD Duo Kit, wymaga weryfikacji/potwierdzenia go testem PCR?
Nie wymaga, ponieważ metoda RT-LAMP należy do grupy metod amplifikacji kwasów nukleinowych (z ang. NAAT) i jest uznana przez WHO oraz Główny Inspektorat Sanitarny (definicja potwierdzonego przypadku COVID-19 – kryteria laboratoryjne), jak również została pozytywnie opiniowana przez Agencję Oceny Technologii Medycznych i Taryfikacji (AOTMiT), jako metoda równoważna metodzie RT-PCR w wykrywaniu RNA wirusa SARS-CoV-2.
Czy wykrycie obecności sekwencji nukleotydowych wirusa przy użyciu testu Genomtec® SARS-CoV-2 EvaGreen® RT-LAMP CE-IVD Duo Kit, jest tożsame z wykryciem genu/genów?
Tak, zestaw starterów w teście wykrywa geny wirusa SARS-CoV-2, a mianowicie gen S i/lub gen N.
Czy jest możliwe ustalenie, który gen/geny odpowiadają za pozytywną reakcję amplifikacji w teście Genomtec® SARS-CoV-2 EvaGreen® RT-LAMP CE-IVD Duo Kit?
Tak, przez przeprowadzenie dodatkowej analizy krzywej topnienia.
Co uzyskuje się poprzez dwudołkową konstrukcję testów?
Poprzez rozdzielnie do dwóch osobnych dołków reakcji amplifikacji genów wirusa SARS-CoV-2 od reakcji namnażania kontroli inhibicji – reakcji ukierunkowanej na gen ludzki – uzyskano skrócenie czasu trwania reakcji oraz obniżenie limitu detekcji RNA wirusa SARS-CoV-2.
Czy możliwe jest użycie śliny, jako materiału badanego, w teście Genomtec® SARS-CoV-2 EvaGreen® RT-LAMP CE-IVD Duo Kit?
Jak najbardziej, pobierając ślinę jako wyjściowy materiał od pacjenta, a następnie postępując zgodnie z zaleceniami producenta użytego zestawu do izolacji RNA, po czym przeprowadzając reakcję amplifikacji, zgodną z instrukcją testu.
Porównanie Duo Kit RT-LAMP z RT-PCR
| Duo Kit RT-LAMP | RT-PCR | |
| Reakcja odwrotnej transkrypcji | Tak, z jednoczesną reakcją amplifikacji cDNA | Tak, osobny etap temperaturowy dla reakcji amplifikacji |
| Startery/sondy | Wykorzystuje 5 starterów hybrydyzujących dla genu N oraz 6 starterów hybrydyzujących dla genu S , które przyłączają się do 7-8 miejsc w analizowanych sekwencjach. Dzięki temu spada prawdopodobieństwo powielenia, innego niż docelowy, fragmentumateriału genetycznego | Wykorzystuje parę starterów hybrydyzujących, która przyłącza się do jednego miejsca w analizowanej sekwencji oraz jedną sondę molekularną hybrydyzującą, która przyłącza się do fragmentu cDNA, znajdującego się pomiędzy dwoma starterami. |
| Denaturacja termiczna | Etap denaturacji termicznej został wyeliminowany, dzięki zdolności polimerazy Bst do przemieszczania nici DNA | Nici DNA muszą zostać rozdzielone, żeby startery i sondy mogły się przyłączyć do miejsc docelowych |
| Czas trwania procesu | Proces zachodzi w stałej temperaturze 64°C, a protokół amplifikacji kwasu nukleinowego trwa 30 minut | Proces zwykle składa się z trzech etapów. powtarzających się cyklicznie około 40 razy: denaturacja (95°C), przyłączanie (50-60°C), wydłużanie (72°C). Etapy te są poprzedzone reakcją odwrotnej transkrypcji trwającą od 10 do 30 minut. Cały proces analizy, w zależności od badanego materiału oraz użytych odczynników, trwa od 1,5 do 3 godzin |
| Czułość | Pozwala wykryć materiał genetyczny w ilości 10(-15) g | Pozwala wykryć materiał genetyczny w ilości 10(-9) g |
| Niezbędny sprzęt | Termocykler czasu rzeczywistego | Termocykler czasu rzeczywistego |
| Kanał odczytu fluorescencji |
Odczyt badanych genów wirusa (N oraz S) w jednym kanale FAM/SYBR Green (zielony). Kontrola wewnętrzna (IC) genu ludzkiego dla próbki badanej, zlokalizowana jest w osobnym dołku – odczyt także w kanale FAM/SYBR Green (zielony) |
Występuje wiele kanałów odczytu sygnału fluorescencji dla analizowanych genów w wyniku hybrydyzacji z sondami znakowanymi różnymi barwnikami |
| Możliwość rozróżnienia, który gen odpowiada za pozytywny wynik reakcji | Na zasadach analizy krzywych topnienia produktu amplifikacji dla analizowanych sekwencji genów N i S. | Reakcja dla poszczególnych genów odczytywana jest w osobnych kanałach odczytu fluorescencji |
Jesteś zainteresowany naszym produktem?
Zadzwoń: